水蚤(Daphnia pulex)作为淡水生态系统中一个关键物种，数十年来一直用来诊断是否存在问题化学品。这种微小的甲壳类动物最好的功能是具有可测定和分析的遗传密码序列，这种序列揭示了迄今为止最多的基因特征。

2月4日《科学》杂志发表了由水蚤基因组联盟和美国能源部联合基因组研究所共同研究发现的水蚤(Daphnia pulex) 200万个基础基因组。研究人员一直研究作为定点物种法的水生模型系统，旨在诊断问题化学物质的存在并推断其影响。基因组信息可以帮助研究者对环境整治实时监控系统进行开发及管理。

项目负责人--印第安纳大学基因组学和生物信息学中心主任约翰·科尔布纳说：“水蚤是世界各地环保机构采用的最广泛的模型系统之一。水蚤的潜在价值足以克服由环境评价条件和供水带来的昂贵挑战。早期的环境风险探测器能够对试验动物的应激反应作出诊断和强有力的信号识别。初步研究显示，水蚤的基因演变是对环境变化的微调。”通过水蚤辨认基因功能和疾病之间的关联，从而用于环境研究。国家卫生研究院开展的生物医学研究采用水蚤包体模型系统，并参与建立类似果蝇和线虫蠕虫病毒的模型。科尔布纳指出，水蚤基因组学联盟正进行大规模的基因组数量分析，以更好地跟踪管理整治应用工作。

除了环境监测，巴黎圣母院大学迈克尔·福冉德指出水蚤基因组还可用于开发商用生物燃料。他说：“当对生长在大型露天水箱内的海藻进行生物燃料产品选择时，它们正被具有蚕食海藻能力的水蚤入侵，你面对的将是学习如何控制水蚤或学习如何用它来收获碳氢化合物的问题。”

美国能源部联合基因组研究所对水蚤进行了测序和注解。真核基因组艾格·艾迪拜约组长指出，用桑格法测序的水蚤基因组中有超过31万个基因组的排列最为紧密；而约1/3基因组的功能未知，出现大量基因的现象主要归因于基因的串联重复扩张。同时他指出，“水蚤比人类和其他任何生物都具有更多的基因”。

由美国科学能源部支持的美国能源部联合基因组研究所致力于推进基因组学研究来支持能源部有关清洁能源和环境特性及清理方面的工作。美国能源部联合基因协会总部位于加利福尼亚州沃尔纳特克里克，它提供集成的高通量测序和计算分析，以便通过以科学方法为基础的系统来应对这些挑战。

(摘自：http://www.waterlink-international.com/news/id1685-Waterflea_Genes_Indicate_ Environ mental_Change.html)